Για δεύτερη συνεχόμενη χρονιά, το κύπελλο θα διεξαχθεί με τη συμμετοχή μόνο των ομάδων της Α2 και της Α1. Στον πρώτο γύρο θα πάρουν μέρος οι ομάδες της Α2, με έξι από της ομάδες της Α1 να ρίχνονται στη μάχη στη δεύτερη φάση και τον Απόλλωνα Πάτρας να είναι ο τυχερός της κλήρωσης, καθώς προκρίθηκε απευθείας στη 2η αγωνιστική της 2ης φάσης.
Οσον αφορά την πρώτη φάση, το ματς που “κλέβει” την παράσταση είναι το Κόροιβος-ΑΕΚ, μεταξύ δύο ομάδων δηλαδή που αναμένεται να πρωταγωνιστήσουν στο νέο πρωτάθλημα της Α2.
Α’ Φάση (Σάββατο 14/9/2013)
1. Ερμής Λαγκαδά-ΚΑΠ
2. Ίκαροι Σερρών-Ψυχικό
3. Φιλαθλητικός-Παγκράτι
4. Αρκαδικός-Φίλιππος Βέροιας
5. Λαύριο-Καβάλα
6. Ηρακλής-ΟΦΗ
7. Κόροιβος Αμαλιάδας-ΑΕΚ
Β’ Φάση
1η αγωνιστική (Σάββατο 21/9/2013)
8. ΝΑ4-Πανελευσινιακός
9. ΝΑ7-Κολοσσός Ρόδου
10. ΝΑ6-Ν. Κηφισιά
11. ΝΑ1-Ηλυσιακός
12. ΝΑ5-ΚΑΟΔ
13. Ίκαρος-Αίολος Τρικάλων
14. ΝΑ2-ΝΑ3
* Ο Απόλλων Π. κατόπιν κλήρωσης θα περάσει στην επόμενη αγωνιστική χωρίς αγώνα.
2η αγωνιστική (Σάββατο 28/9/2013)
15. Ν11-Ν13
16. Ν8-Ν10
17. Απόλλων Π.-Ν14
18. Ν9-Ν12
3η αγωνιστική (Σάββατο 5/10/2013)
19. Ν15-Ν17
20. Ν18-Ν16
Γ’ Φάση/Προημιτελικοί (Τετάρτη 9/10/2013)
21. Ρέθυμνο-Παναθηναϊκός
22. Πανιώνιος-ΝΒ20
23. ΝΒ19-Ολυμπιακός
24. ΠΑΟΚ-Άρης